comparison between rt- pcr and viral isolation for detection of h9 subtype of avian influenza viruses

[ ' d u r i n g 2 0 0 4 ' , 2 0 0 6 , ' a t o t a l n u m b e r o f 2 2 t i s s u e s a m p l e s o b t a i n e d f r o m p o u l t r y f l o c k s s u s p e c t e d t o r e s p i r a t o r y d i s e a s e s s u b m i t t e d t o a v i a n v i r o l o g y l a b o r a t o r y o f f a c u l t y o f v e t e r i n a r y m e d i c i n e ' , ' w e r e p r e p a r e d f o r a v i a n i n f l u e n z a v i r u s ( a i v ) i s o l a t i o n i n e m b r y o n a t e d c h i c k e n e g g s ' , ' a c c o r d i n g t o t h e s t a n d a r d m e t h o d . r t ' , ' p c r w a s e s t a b l i s h e d o n t i s s u e s a m p l e s u s i n g s p e c i f i c p r i m e r s f o r h 9 g e n e . a m p l i f i e d p c r p r o d u c t s w e r e 4 3 5 b p i n l e n g t h . a n a l y t i c a l s e n s i t i v i t y o f t h e r t ' , ' p c r w a s 1 0 3 . 5 e i d 5 0 a n d s e n s i t i v i t y ' , ' s p e c i f i c i t y a n d c o r r e l a t i o n r a t e c o m p a r e d w i t h v i r u s i s o l a t i o n ' , ' w e r e 1 0 0 % ' , ' 9 4 % a n d 9 5 % ' , ' r e s p e c t i v e l y . t h e r e s u l t s s h o w e d t h a t t h e r t ' , ' p c r a s s a y u s i n g h 9 g e n e s p e c i f i c p r i m e r s ' , ' d i r e c t l y o n t i s s u e s a m p l e s ' , ' c o u l d b e u s e d i n r a p i d d e t e c t i o n a n d s u b t y p i n g o f h 9 a i v s a s a u s e f u l a l t e r n a t i v e t o v i r u s i s o l a t i o n a s s a y . ' ]